Коробка (1С:УНФ, Битрикс24, МойСклад) — правильный первый выбор, когда процессы стандартные: продажи, склад, несложное производство. Внедрение за недели, предсказуемый ценник, обновления за счёт вендора.
Кастом оправдан, когда специфика процессов — ваше конкурентное преимущество, а коробку пришлось бы «допиливать» дороже, чем писать своё. Честный ответ часто посередине: коробка как ядро плюс небольшие доработки по краям.