1С почти всегда остаётся ядром учёта: бухгалтерия, зарплата, налоги. Интеграция нужна, чтобы цеховая система (MES, CRM, WMS) не превращалась в отдельный остров с ручным переносом данных.
Технически обмен делается через HTTP-сервисы или планы обмена 1С; главное — договориться, какая система «хозяин» каждого справочника. Как связать учёт и производство без боли — в отдельной статье.